В 1661 году Чжэн Чэнгун атаковал голландцев на Тайване и те оставили Норт-Холланд, но в 1663 году отбили его обратно. Однако в связи с завоеванием Китая маньчжурами торговля с китайскими землями стала для голландцев невыгодной, нужда в опорном пункте отпала, и в 1668 году они окончательно оставили форт.

Впоследствии эти места долгое время оставались неразвитыми. Лишь в середине XIX века после поражения в Опиумных войнах Цинская империя была вынуждена в 1863 году открыть местную гавань для торговли с иностранцами. В 1871 году здесь было учреждено командование береговой обороны, а в конце 1875 года здесь был открыт филиал Тайбэйской управы и для этих мест было официально утверждено написание 基隆 (ранее название этих мест записывалось иероглифами 鸡笼). В 1887 году был образован Цзилунский комиссариат (基隆厅).

После поражения Цинской империи в первой японо-китайской войне остров Тайваньбыл в 1895 году передан Японской империи; японцы читали иероглифы, которыми записывалось название этих мест, как «Кирун». Японские власти вложили огромные средства в модернизацию и развитие Кирунского порта. В 1920 году Тайваньбыл разделён на префектуры, и Кирунский комиссариат был преобразован в уезд Кирун (яп. 基隆郡) префектуры Тайхоку (яп. 台北州). В 1924 году посёлок Кирун уезда Кирун был повышен в статусе и стал городом. После начала Второй мировой войны Кирун, будучи важнейшим портом Тайваня стал одной из основных целей американских бомбардировок, и к концу войны порт был практически полностью уничтожен.

После поражения Японии во Второй мировой войне остров Тайваньбыл в 1945 году возвращён Китаю; префектура Тайхоку стала уездом Тайбэй, а уезд Кирун — районом Цзилун (基隆区) в его составе, город Цзилун же стал городом провинциального подчинения.

Климат

Цзилун находится в зоне субтропического океанического климата со средей годовой нормой осадков 3700 мм, что способствовало его прозвищу «Порт дождя». Зима короткая и мягкая, лето — продолжительное и жаркое. Зимой и весной часты туманы.