Музей значительно пострадал в годы постсоветского хаоса в начале 1990-х годов. Он был поврежден в ходе военного переворота в 1991—1992 годах, а затем часть его коллекции уничтожил пожар.

В конце 2004 года музей искусств Грузии вошёл в единую систему управления с рядом других музеев, образовавших Грузинский национальный музей.

Музей занимает несколько зданий в центре Тбилиси, основная экспозиция расположена на проспекте Руставели. Главное здание музея было спроектировано в 1910 году, по проекту архитектора Николая Северова на месте старого, обветшавшего здания. В оформлении постройки использованы элементы средневекового грузинского декора.

Коллекция

Музей содержит тысячи грузинских и кавказских археологических и этнографических памятников. Постоянная экспозиция демонстрирует в хронологическом порядке историю Грузинской культуры от бронзового века до начала XX столетия. Наиболее ценные экспонаты музея включают в себя:

• Обнаруженные в Дманиси окаменелые останки гоминида Homo Ergaster,
• Клад из Ахалгори (V до н. э.) содержащий уникальные примеры ювелирных украшений соединивших в себе стиль декоративно-прикладного искусства Ахеменидского Ирана и местную традицию,
• Коллекцию из 80000 монет, главным образом грузинской чеканки,
• Средневековые металлические иконы и образцы золотой ковки,
• Одну из самых больших в мире коллекций урартских надписей на камне.

В музее находится абстрактная картина, написанная Василием Кандинским в конце 1900-х годов; по мнению ряда исследователей, это первый пример абстракционизма в современном искусстве.