Остальная часть храма была построена в середине XVII века как базилика, представляющая собой в плане прямоугольный трехнефный собор с пресвитерием, завершающимся граненной трехстенной апсидой. Средний неф имеет высоту 30 метров. На углу западного фасада поднимается мощная башня-колокольня высотой 55 метров, построенная в XVIII веке.

В XVII и XVIII веках церковь сильно пострадала от пожаров и войн. В 1775 году в церкви был построен главный алтарь, сохранившийся до наших дней. В 1800 году пережила реставрацию, после которой почти не изменилась.

В 1893-1897 годах по замыслу архитектора Г.Вернера к боковой стене пресвитерия пристроили часовню в неоготическом стиле, отличающуюся изящными формами и пропорциями внутреннего убранства и высокохудожественным декором.

Приблизительно через 100 лет храму присвоили статус кафедрального собора. В 1921 году, в честь юбилейного 500-летнего основания Жемайтийского епископата, собору присудили титул базилики. После учреждения церковной провинции Литвы, базилика стала Кафедральным собором с троном архиепископа митрополита.

Современный стиль собора святых Петра и Павла можно отнести к переходному стилю от готики к ренессансу. Интерьер, состоящий из готических элементов, сохранил только сетчатые нервюрные своды в пресвитерии и ячеистые – в помещении, для хранения культовых принадлежностей (сакристии). В нем преобладает стиль позднего барокко. Везде присутствуют колонны коринфского ордера.

В декоративном убранстве собора привлекают внимание девять алтарей. Они установлены в восточных концах нефов и у столбов таким образом, что пышность общей композиции соборного убранства возрастает по направлению к величественному двухъярусному главному алтарю со скульптурами и картиной «Распятие и Мария Магдалина», созданной неизвестным художником.

Трехъярусный алтарь из дерева в левом нефе (XVII век) имеет исключительно высокую художественную ценность. Орнамент в виде виноградной лозы насквозь прорезает его полые колонны. Алтарь украшен картинами неизвестного художника «Вознесение девы Марии» и «Коронование Богоматери» (XVII век), медальонами и декоративной резьбой. На стенах и в других алтарях также можно увидеть много ценных в художественном смысле картин. Среди них особенный интерес вызывают «Обращение святого Павла» и «Чудесная ловля рыб», выполненные живописцем М.Е.Андриолли (конец ХIХ века).

Собор известен образом Страдающей Божьей Матери. Это самый старинный образ каунасского храма. Считается, что он дарит избавление. Об этой вере говорят жертвенные приношения прихожан, помещенные по обе стороны от образа, который признан чудотворным уже в XVII веке.

Абсолютно органичное соединение стилей готики, барокко и историзма является главным достоинством собора.

 Адрес: Vilniaus g. 1,Kaunas 44281,Литва
 Телефон(ы): +370 37 324093