С 1992 по 1997 год город являлся резиденцией генерала Абдул-Рашида Дустума. С 1998 по 2001 год контролировался движением Талибан; после взятия города талибы организовали в нём резню непуштунского населения, в ходе которой погибло, по самым скромным оценкам, не менее 2000 человек. 25 ноября 2001 года в превращенном в тюрьму форте «Калай-Джанги» (Galai Janghi) в окрестностях Мазари-Шарифа произошёл кровавый бунт пленных талибов, при подавлении которого погибло около 700 человек.

Транспорт

Мазари-Шариф является основным торговым и транспортным центром северного Афганистана. 21 декабря 2011 года была сдана в эксплуатацию первая железная дорога в стране, она соединила узбекскую границу и порт Хайратон с аэропортом в Мазари-Шарифе (75 км). Грузы прибывают на товарных поездах, и далее перегружаются на самолёты и грузовики для дальнейшей перевозки по стране. По мере роста экономики, это создаст много новых рабочих мест для местного населения и увеличит доходы городской казны.

В городе действует аэропорт, осуществляются регулярные рейсы из Кабула. Автомобильными дорогами Мазари-Шариф связан с Гератом, Кабулом, Термезом (Узбекистан).

Достопримечательности

В Мазари-Шарифе находится уникальный храмовый комплекс Розии Шариф (Голубая Мечеть). По местным легендам это — могила халифа Али, тело которого выкрали похитители. По этой причине Мазари-Шариф служит местом поклонения, особенно шиитов. Настоящая могила халифа Али находится в городе Неджефе в Ираке, однако дополнительные мазары как места поклонений — явление частое в афганской и таджикской религиозной практике.

По мнениям некоторых историков, в этом месте была могила Зороастра.