Имя Папы Римского Иоанна Павла II было присвоено аэропорту в 1995 г. Сам Иоанн Павел II неоднократно бывал в Балице при своих поездах в Польшу во время понтификата.

История

• С 1923 г. пассажирские перелёты из Кракова осуществлялись с аэропорта Краков-Раковице-Чижины, ликвидированного в 1963 г. С 2005 г. часть его взлётно-посадочной полосы используется в составе аэропорта-музея.
• В 1964 г. часть существовавшего военного аэродрома в Балицах начинает использоваться для гражданских перевозок.

• В 1995 г. аэропорт получает имя Иоанна Павла II.
• 29 апреля 2009 г. в аэропорту совершил посадку Boeing 747-400 (Jumbo Jet) израильской авиакомпании El Al. Это было доказательством того, что аэропорт может принимать самолёты такого класса. Но они не могут иметь максимальную нагрузку, потому что взлётно-посадочная полоса короткая для их разбега.
• В 2003 г. ирландский низкобюджетный авиаперевозчик Ryanair начал переговоры с целью организации полётов из краковского аэропорта. Но авиационные власти не согласились снизить аэропортовый сбор, поэтому власти города и Малопольского воеводства решили построить второй терминал для бюджетных авиалиний. Но возникли трудности, связанные с тем, кто является владельцем аэропорта и кто будет отвечать за этот терминал. Но хотя новый терминал не был построен, появление первых дешёвых перевозчиков вынудило традиционные авиакомпании снизить цены на некоторых направлениях.
• В 2004 г. появились новые маршруты в Центральную Европу. После короткого спада числа пассажиров оно снова стало динамично прибывать. Но сильным конкурентом стал аэропорт Катовице, которому удалось наладить значительно лучшие отношения с бюджетными авиакомпаниями.
• 13 ноября 2004 года бюджетный перевозчик easyJet начал регулярное авиасообщения с Краковом

• В 2004 г. появилась идея открытия железнодорожного сообщения между аэропортом и центром города. С этой целью были использованы пути железной дороги, использовавшейся для транспортировки цистерн с топливом к военно-воздушной базе. С 26 мая 2006 года между железнодорожным вокзалом Краков-Главный и аэропортом Краков-Балице курсирует рельсовый автобус. Его станция расположена в 200 м от пассажирского терминала аэропорта. Поездка из центра города до аэропорта занимает около 18 минут.
• 28 февраля 2007 г. открыт внутренний терминал площадью 1733 м², который может обслужить 500 тыс. чел. в год. Интресно, что первоначальным назначением здания терминала было использование его в качестве гаража для техники, обслуживающей аэропорт.
• 17 мая 2007 г. введено в эксплуатацию новое здание пожарной охраны, размещенное у контрольной полосы аэропорта, что обеспечило возможность сокращение времени реакции спасательных и пожарных служб до 90 секунд.
• 20 июля 2007 г. открыта новая часть международного терминала площадью 3000 м², с 15 стойками регистрации и 5 пунктами контроля. Это был второй этап подготовки аэропорта к вступлению Польши в Шенген, произошедшим в воздушном сообщении 1-го марта 2008 г.

• 4 сентября 2007 название аэропорта изменено с Międzynarodowy Port Lotniczy im. Jana Pawła II Kraków-Balice на Kraków Airport im. Jana Pawła II.
• 27 ноября 2007 г. аэропорт утратил статус «пересадочного узла» словацкой бюджетной авиакомпании SkyEurope Airlines и соответственно — 19 направлений авиасообщений.
• 20 декабря 2007 г. аэропорт обслужил трёхмиллионного пассажира в 2007 г.
• 9 января 2008 авиакомпания Germanwings объявила о переносе с 1-го апреля своих рейсов в Кёльн и Штутгарт в аэропорт Катовице. Рейсы Germanwings вернулись в Краков 15 июня 2009 г..
• 1 марта 2010 г. открыт новый паркинг, расположенный у международного терминала.
• В августе 2011 авиакомпания Ryanair обслужила четырёхмиллионого пассажира краковского аэропорта.
• 26 ноября 2011 малопольский воевода дал разрешение на строительство пассажирского терминала. Общая площадь терминала будет составлять 55 тыс. м² полезной площади, ежегодно он сможет обслуживать 8 миллионов пассажиров.
• С 24 апреля 2012 г. бюджетная авиакомпания Volotea начала регулярное сообщение с Венецией, а с 26 апреля авиакомпания Аэрофлот начала регулярные полёты в Москву.
• С конца сентября 2014 г. Аэрофлот прекратил рейсы из Кракова в Москву.
• В сентябре 2015 года открыто железнодорожное сообщение между аэропортом Краков-Балице, Центральным железнодорожным вокзалом в Кракове и пригородом Величка..
• В июле 2016 года два пассажирских терминала были объединены в единый терминал.
• В июле 2017 года открыто первое прямое пассажирское межконтинентальное сообщение между аэропортами Краков-Балице и Чикаго О’Хара..
• В ноябре 2017 года аэропорт Краков-Балице обслужил пятимиллионного пассажира за 2017-й год. Таким образом пассажирооборот аэропорта превысило 5 миллионов в год..

Будущее

В течение ближайших 20 лет планируется дальнейшее расширение аэропорта. Ещё недавно планировалось, что в 2015 г. аэропорт должен принять 3.5 млн пассажиров, а 10 лет спустя — 6.5 млн. Однако темпы роста пассажиропотока значительно выше, чем предполагалось. К 2021 году планируется открытие новой взлетно-посадочной полосы..

Направления и авиакомпании

Пассажирский терминал

• Аэрофлот (Москва) — с сентября 2014 года рейсы прекращены
• Aer Lingus (Дублин)
• Austrian Airlines
  • обслуживается через Austrian Arrows (Вена)
• Brussels Airlines (Брюссель)
• Czech Airlines (Прага)
• easyJet (Белфаст, Бристоль, Эдинбург, Ливерпуль, Лондон-Гатвик, Париж — Шарль-де-Голль, Женева)
• EuroLOT (Амстердам [с 6 июня 2012 г.], Дубровник [с 9-го июня 2012 г.], Флоренция [с 7-го июня 2012 г.], Гамбург [с 12-го июня 2012 г.], Heringsdorf/Świnoujście [с 15-го июня 2012 г.], Львов [с 14-го мая 2012 г.], Вильнюс [с 1-го июля 2012 г.], Цюрих [с 12-го июня 2012 г.])
• Finnair (Хельсинки)
• Germanwings (Штутгарт)
• Iceland Express (Рейкьявик) [сезонно]
• Jet2.com (Ньюкасл)
• LOT (Афины, Франкфурт, Париж — Шарль-де-Голль, Рим-Фьюмичино, Чикаго)
  • обслуживается EuroLOT (Вена, Варшава, Гданьск, Познань, Щецин)
• Lufthansa
  • Lufthansa Regional обслуживается Lufthansa CityLine (Дюссельдорф, Франкфурт, Мюнхен)
• Norwegian (Берген, Копенгаген, Осло, Ставангер, Стокгольм-Арланда, Хельсинки)
• Ryanair (Аликанте, Барселона, Биллунн, Болонья, Брюссель, Будапешт, Кальяри, Дублин, Восточный Мидландс, Эдинбург, Эйндховен, Лидс-Брадфорд, Ливерпуль, Лондон-Станстед, Мадрид, Малага, Мальта, Милан-Бергамо, Осло, Пафос, Пальма-де-Майорка, Париж — Бове, Пиза, Рим — Чампино, Стокгольм-Скавста, Трапани)
• Trawel Fly (Неаполь) [сезонно]
• Volotea (Венеция)
• WOW air (Рейкьявик) [с 12 июня 2012]
• Международные авиалинии Украины (Киев) [с 26 декабря 2017]

Чартерные направления

• Болгария
  • Бургас
• Египет
  • Хургада, Шарм-эш-Шейх
• Греция
  • Корфу, Кос, Крит, Родос
• Испания
  • Фуертевентура, Гран Канария, Пальма де Майорка
• Израиль
  • Тель-Авив
• Португалия
  • Фару
• Тунис
  • Энфидха, Монастир
• Турция
  • Анталья, Бодрум, Даламан