Жан-Батист Баргуэн родился 20 июня 1813 года и очень скоро осиротел. Он получил образование фармацевта и познакомился с Анри Лекоком, который вскоре предложил ему стать компаньоном. Фармацевт и промышленник сделали огромное состояние на изготовлении и продаже эрзац-кофе («Сладкий жёлудь»), состав которого (смесь каменного дуба, цикория, ржи и иногда каштана) был разработан Баргуэном. Баргуэн скончался 24 июля 1885 года не оставив наследников; в своём завещании он оставил 200 000 франков городу Клермон-Ферран для строительства специализированного здания музея.

Потребовалось почти 15 лет чтобы 18 июня 1900 года по конкурсу из 26 проектов утвердить архитектора нового здания. И 11 октября 1903 года состоялось торжественное открытие нового здания Музея Баргуэна.

Экспозиция музея

Изначально, в XIX веке, музей задумывался как исключительно художественный музей, но после своего открытия в 1903 году в его экспозицию также включили археологическую коллекцию, содержащую предметы, найденные в окрестностях Клермон-Феррана. После передачи художественных коллекций во вновь построенный Музей изобразительных искусств Роже-Кийо в конце XX века, здесь освободились дополнительные выставочные площади для археологической коллекции, а затем и для коллекции ковров и текстильных изделий.

В настоящее время на втором и третьем этажах музея представлены коллекции текстильного мастерства, в которых собрано более 80 ковров, выполненных мастерами Средней Азии и Дальнего востока. Помещения первого этажа целиком посвящены археологии, а в климатизированном подвале представлена исключительная коллекция галло-романских вотивных предметов (подношения божествам), найденная на месте археологических раскопок Source des Roches неподалёку от коммуны Шамальер.

В декабре 1997 года муниципалитет Клермон-Феррана приобрёл для музея коллекцию античных монет — золотых арвернских статеров с изображением вождя арвернов Верцингеторига. Эти монеты были найдены в городе Иссуар в XIV веке и в 1998 году пополнили археологическую коллекцию музея Баргуэна.