Иногда на картах неаполитанского метрополитена изображают также линии № 2, № 3, № 4, № 5 и № 7, формально к неаполитанскому метро не относящиеся, а являющиеся линиями пригородной железной дороги и управляемые другими железнодорожными операторами.

• № 2 — это реконструированный участок пригородной железной дороги Passante ferroviario di Napoli (управляется Trenitalia), построенной еще в 1925 году, имеющий длину 14 км. Линия в центре города — глубокого заложения, в западной части — наземная.
• № 3 и № 4 — неаполитанские части системы Circumvesuviana (управляется компанией Circumvesuviana), образованной несколькими пригородными железнодорожными ветками. Воспользовавшись Circumvesuviana, можно попасть к Помпеям и Везувию, а также в Сорренто. Circumvesuviana начинается на вокзале Stazione Сentrale, идет вокруг Неаполитанского залива, через Помпеи, Геркуланум, а заканчивается в Кастелламмаре-ди-Стабия (Сорренто). Поездка займет около часа времени, ориентировочная стоимость билета — от 3 евро. Сайт Circumvesuviana: Vesuviana.it
• № 5 и № 7 — линии пригородной железной дороги, наземные и частично неглубокого заложения. № 5 направлена из центра на запад, а № 7 — кольцевая, частично использует участок линии № 5. Эти линии управляются компанией Sepsa.