В 1559 году испанский король Филипп II основал Аудиенсию де Чаркас в Ла-Плата, наделив её властью над территорией, которая в настоящее время охватывает Парагвай, юго-восток Перу, Северный Чили и Аргентину, а также большую часть Боливии. Аудиенсия де Чаркас был частью Вице-королевства Перу до 1776 года, когда он был передан во вновь созданный Рио-де-ла-Плата. В 1601 году францисканцами был основан монастырь Реколета, а в 1609 году в городе была основана архиепископская церковь. В 1624 году был основан Университет Св. Франциска Ксавье в Чукисака.

В колониальную эпоху Сукре был очень похож на испанский город: узкие улочки центра города спроектированы в виде сетки, отражая андалузскую культуру, которая воплощена в архитектуре больших домов города и многочисленных монастырей и церквей. Сукре остаётся резиденцией римско-католической церкви в Боливии. В городе живут члены религиозных орденов, одетые в традиционные костюмы. На протяжении большей части своей колониальной истории умеренный климат Сукре предпочитали испанские королевские особы и богатые семьи, занимающиеся торговлей серебром из Потоси. Свидетельством тому является замок Глориета. Университет Сукре является одним из старейших университетов в Новом Свете.

25 мая 1809 году движение за независимость Боливии было начато со звонка колокола базилики Святого Франциско. Этот колокол звенел до поломки, но его до сих пор можно найти в базилике: это одна из самых ценных реликвий города. До XIX века Ла-Плата была судебным, религиозным и культурным центром региона. Он был провозглашён временной столицей нового независимого Альто-Перу (позднее Боливия) в июле 1826 года. 12 июля 1839 года президент Хосе Мигель де Веласко издал указ, согласно которому город переименовали в честь революционного лидера Антонио Хосе де Сукре и объявили столицей Боливии. После экономического спада Потосии и промышленности по добыче серебра, столица Боливии была перенесена в Ла-Пас в 1898 году. В 1991 году Сукре стал объектом Всемирного наследия ЮНЕСКО .

Город привлекает тысячи туристов каждый год благодаря хорошо сохранившемуся центру города со зданиями XVIII и XIX веков. Расположенный у подножия холмов-близнецов Чурукелла и Сика Сика, Сукре является воротами в многочисленные небольшие деревни, относящиеся к колониальной эпохе, наиболее известной из которых является Тарабуко, где проводится красочный фестиваль «Пуджлай», проводимый в марте. Большинство их жителей являются представителями одной из коренных этнических групп. Многие одеваются в одежду, характерную для их соответствующих деревень.