• отдел     истории     (с     залами     первобытнообщинного     строя, рабовладельческого и феодального периода)
• общий отдел,   в котором размещались коллекция оружия XVI-XX вв., коллекция монет, медалей, гравюр и экспозиция, посвященная освобождению края в 1940-м году   и восстановлению Советской власти. Во время войны музейный фонд был разграблен.

В годы Второй мировой войны музей был разрушен, фондовые материалы вывезены и только часть была возвращена.

Открытие новой экспозиции состоялось уже 8 ноября 1946 г., которая разместилась по ул. Пушкина, 19 (ранее дом купца II-ой гильдии М.К. Фемилиди), где находится по настоящее время.

В 1982 году при краеведческом музее был открыт выставочный зал для экспонирования художественных выставок и выставок прикладного искусства. В 1990 году был открыт отдел «Этнография народов юга Приднестровья».

На сегодняшний день, фондовая коллекция музея составляет уже более 84 тыс. экспонатов. Включает в себя самые разнообразные экспонаты – это предметы археологии, историко-бытовые, нумизматики и искусства. Одной из богатейших  является археологическая коллекция античного города Тиры и Черняховской культуры (VI в. до н. э. – IV в. н. э.). Вызывает интерес и коллекция огнестрельного и холодного оружия XVIII - XIX вв., уникальные рукописные и печатные документы по истории иностранной колонизации края первой половины XIX века., а также естественноисторические предметы в экспозиции зала «Природа края».

Материалы из фондовой коллекции музея являются порой единственным источником для изучения истории края как для отечественных, так и для зарубежных ученых. По результатам многих исследовательских работ были опубликованы фундаментальные монографии ученых Румынии, Франции, Швейцарии и Германии.

Директора

• 1944‒1945 — Бернер Николай Иванович
• 1945‒1946 — Михайличенко А.Б.
• 1946‒1953 — Крысин Георгий Петрович
• 1953‒1958 — Миронов Вадим В.
• 1958‒1959 — врио Авербух Полина Колмановна
• 1959‒1963 — Роднов Георгий Иванович
• 1963‒1976 — Криволап Григорий Иванович
• 1976‒1983 — Полевой Николай Петрович
• 1983‒1987 — Шаров Аркадий Федорович
• 1987‒1989 — Шевченко Фаина Александровна
• 1989‒2007 — Коренева Людмила Евгеньевна
• С 2007 года по настоящее время — Белая Татьяна Павловна

Экспозиция

В главном здании музея, размещена постоянно-действующая экспозиция которая  размещена в девяти больших залах и предоставляет материалы об истории края с древнейших времен и по современный период. Представители флоры и водной и прибрежной фауны Днестра и Черного моря,  животный и растительный мир, а также прекрасная орнитологическая коллекция в зале «Природа края» завершают знакомство с одним из старейших музеев региона.

Выставочный зал

В выставочном зале Белгород-Днестровского краеведческого музея предоставляется возможность презентовать свои работы, как профессиональным мастерам, так и талантливым арматорам города, художникам  из  разных регионов страны, ближнего и дальнего зарубежья.

Художественные, выставки декоративно-прикладного искусства, фотодокументальные, передвижные из фондов музея, а также коммерческие выставки неоднократно с успехом экспонируются.

"Этнография народов юга Приднестровья"

Этнографическая коллекция представлена в старом купеческом особняке по ул. Пушкина, 16. Самобытная экспозиция - «Этнография народов юга Приднестровья» представлена оригинальными орудиями труда и предметами быта,  ремесленными изделиями из кожи, глины и дерева. Особый интерес вызывает коллекция разнообразных редких домотканых рушников, ковровых изделий ручной работы, свадебные традиции, костюмы и женские украшения многонационального населения Бессарабии.

Мемориал славы

Мемориальный музейный комплекс в сквере «Воинской славы» включает в себя фотодокументальную выставку посвященную освободителям города от немецко-фашистских захватчиков в 1944 г., а также передвижную выставку «Поколение победителей» посвященную о жителям города - участникам Второй мировой войны, и постоянно действующую выставку о воинах интернационалистах.