В соответствии с Приказом Комитета по науке Министерства образования и науки Республики Казахстан от 1 июня 2010 года № 35-ПР, с целью сохранения, изучения и популяризации музеев и коллекций, широкого распространения научного, исторического и культурного наследия и проведения научно-исследовательских и культурно-просветительских работ в ведение центра «Гылым ордасы» перешёл Музей археологии Казахстана.

В 2012 году музей вновь открылся после реставрации в рамках комплекса «Ғылым ордасы» по новому адресу — в здании Академии наук Казахстана.

Экспозиция

В 1946 году А.Х. Маргулан стал организатором и руководителем Центрально-Казахстанской археологической экспедиции, которая открыла на территории Казахстана крупнейший очаг цивилизации эпохи поздней бронзы Бегазы-Дандыбаевскую культуру. Находки этой экспедиции стали основной частью экспозиции во время открытия музея в 1973 году.

В настоящее время Музей археологии, функционируя в системе научного комплекса «Ғылым ордасы», продолжает работы по комплектованию фондов, принимая находки ведущих археологов из всех регионов страны. На основе имеющегося и вновь приобретаемого материала в стенах комплекса создана новая научная экспозиция, освещающая все периоды древней истории Казахстана от Каменного века до Средневековья. В экспозиции представлены уникальные, имеющие общемировое значение материалы из раскопок могильников эпохи бронзы; коллекция, относящаяся к эпохе саков и усуней, находки из керамики, стекла и монет из раскопок средневековых городов Отрара, Тараза, Туркестана, Талгара.