Из-за того, что перед мечетью стоял фонтан, она также называлась «мечетью нижнего фонтана» (Τζαμί του Κάτω Σιντριβανιού), а благодаря близости к агоре, её назвали «мечетью нижнего рынка» (Τζαμί του Κάτω Παζαριού). Иногда её коротко именовали «мечетью Паши». Недалеко от неё стоял и дом самого воеводы.

Во время Греческой войны за независимость в мечети Цисдараки собирался местный совет старейшин. После войны это здание использовалось в различных целях, например, здесь в марте 1834 года прошёл бал в честь короля Оттона I, после чего тут были бараки, тюрьма, склад, зал для репетиций военного оркестра. В настоящее время о том, что это была мечеть, напоминает только михраб внутри и два михраба снаружи по сторонам от главного входа. Минарет был разрушен во время революции.

В 1915 году мечеть была частично восстановлена архитектором Анастасиосом Орландосом (Αναστάσιος Ορλάνδος) и через три года стала музеем Греческих произведений ручной работы (в 1923 он был переименован в Национальный музей декоративного искусства). В 1973 году основная коллекция музея Народного творчества переехала в здание в районе Плака, и мечеть превратилась в один из его трёх филиалов.

В 1981 году мечеть была частично разрушена землетрясением и вновь открылась лишь в 1991 году.

В настоящее время в мечети Цисдараки выставлена коллекция фарфора Кириазопулу (Β. Κυριαζόπουλου), которая включает 800 предметов, созданных, в основном, в первые десятилетия XX века. На двух этажах представлены пять крупных производителей фарфора Греции, Кипра и Малой Азии: Минас Аврамидес (1877-1954, Салоники), Макариос Вардаксис (1885 – 1950, Салоники), Димитрис Мигдалинос (Коккина), Николаос Теодору (остров Сифнос), Николаос Ясиранис (1901-1973, остров Родос). Вскоре планируется перевести эту коллекцию в другое здание, в котором будут объединены экспонаты всех филиалов этого музея.

 Адрес: Kidathineon 15, Athina 105 58, Греция
 Телефон(ы): +30 210 324 2066