Главная проблема аэропорта — непостоянные погодные условия области, особенно туман в утренние часы в зимний период. Также существует проблема с вспомогательной взлётно-посадочной полосой 11/29, которая слишком небольшая и состоит из старого оборудования. Есть также планы модернизировать взлётно-посадочную полосу 15/33 системой КГС (категория III).

Главная взлётно-посадочная полоса была удлинена в 2008 году, чтобы позволить грузовым рейсам работать с большими грузами, а также был модернизирован грузовой терминал.

Терминал составляет 26 000 м², имеет 6 телескопических трапов, пропускная способность аэропорта 4,5 миллионов пассажиров в год. Имеется 800 мест для парковки. Комплекс аэропорта включает небольшой музей, игровой центр и торговый ряд с 60 магазинами в главном терминале.

Авиапроисшествия и инциденты

• 16 июня 1958: авиакомпания Serviços Aéreos Cruzeiro do Sul, воздушный лайнер Convair 440-59 регистрация PP-CEP, летевший из аэропорта Эрсилиу Лус (Hercílio Luz), Флорианополис в международный аэропорт Афонсу Пена, выполнял процедуру подхода, чтобы посадить самолёт в Куритибе. Самолёт спустился и ударился о землю. Из 26 пассажиров и членов экипажа на борту, 21 человек погиб.
• 3 ноября 1967: авиакомпания Transbrasil, британский турбовинтовой пассажирский самолёт Handley Page Dart Herald регистрация СТР-SDJ, летящий из аэропорта Конгоньяс/Сан-Паулу в Афонсу Пена, столкнулись с холмом во время спуска, чтобы приземлиться в Куритибе. Все члены экипажа и 21 пассажир погибли, 4 пассажира выжили.

Будущие разработки

31 августа 2009 года Infraero представил план модернизации международного аэропорта Афонсо Пена, сосредоточившись на приготовлениях к чемпионату мира по футболу 2014 года, который будет проходить в Бразилии. Завершение планируется в марте 2011 года.