Система пригородного и внутригородского железнодорожного транспорта, основанная в 1976 году, называется S-Bahn, она входит в состав системы федеральных железных дорог Австрии (ÖBB).

Ядром S-Bahn является так называемый «стволовой коридор» (Stammstrecke), линия длинной 14 км, широкой дугой описывающая центр Вены с северной, восточной и южной сторон. Это — историческая железнодорожная ветка, проложенная еще в 1838–1841 годах, сегодня на ней имеются 8 станций, на некоторых из которых осуществляется пересадка на поезда метро. Также в системе S-Bahn имеется 3 внутригородские линии, некогда соединявшие венские пригороды (S45, S8, S80), 1 однопутная линия Hütteldorf — Meidling с единственной остановкой и 9 пригородных линий (S1, S2, S3, S4, S7, S9, S40, S50, S60).

Интервал движения электропоездов системы S-Bahn составляет 10 минут днем и 20 минут вечером. Для проезда на электропоездах S-Bahn в пределах Вены требуется обычный внутригородской билет, действующий на всех видах общественного транспорта. Пассажир должен самостоятельно прокомпостировать билет в начале поездки.