Морской порт Лос-Анджелеса расположен в 32 километрах к югу от центра, в Сан-Педро. Порт занимает около 30 квадратных километров суши, а береговая линия — 69 километров. Порт Лос-Анджелеса соединяется с портом Лонг-Бич и образует крупнейший портовый район в США. Здесь же находится один из ведущих в мире контейнерных терминалов.

Пассажирские судоходные компании также пользуются воротами Лос-Анджелеса. Так, например, за год порт принимает более 800 тысяч пассажиров круизных судов. В Лос-Анджелесе и его окрестностях расположено также несколько бухт для небольших судов и яхт. Наиболее известные из них — это Редондо-Бей и Марина-дель-Рей.