В середине 16 в. через Бронницы и Коломну на Казань прошло войско Ивана Грозного. В начале 17 в. в селе побывал отряд Ивана Болотникова. В 1608-1610 гг. здесь велись сражения с польскими отрядами.

При царе Михаиле Романовиче в целях усиления конного войска ряд царских владений был преобразован в дворцовые конюшенные волости. В их числе оказалось и село Бронницы. Здесь, в окружении обширных лугов, в 1634 г. была размещена «государева кобылячья конюшня», превращенная со временем в крупный конный завод, где содержали и готовили лошадей к выездам царской семьи. В конюшнях были лошади редких пород, часто даренные правителями других стран русским государям. Бронницы, за исключением двух десятков лет, когда Петр I передавал их в личное владение А.Д. Меншикову, принадлежали царской семье. С 1782 г. получили статус уездного города и центра Бронницкого уезда, образованного за счет отошедших волостей южной части Московской и северной части Коломенского уездов. Тогда же город получил свой герб.

Жители Бронниц занимались не только обслуживанием государевых конюшен. Было развито в уезде и хлебопашество, скотоводство, огородничество, садоводство, торговля, ремесла. По Экономическим примечаниям, составленным на 1760 г., в с. Бронницы состояло «купцов, мещан и разного звания жителей мужин 639, земли под селением 126 десятин... селение стоит при озере Вольском», «...в том городе две церкви: 1-я Архистратига Божия Михаила, 2-я Иоанна Милостивого». В 1787 г. жителей в Бронницах уже 1542 человека. В 1801 г. был ликвидирован соседний Никитский уезд, большая часть его селений также отошла к Бронницкому уезду. В таком виде уезд сохранялся до 1929 г., когда была проведена реорганизация губерний и волостей в области.

Современный город имеет интересную планировку. Застраивался он в соответствии с высочайше утвержденным планом, составленным в 18 в.: в виде правильных четырехугольных» 600х400 саженей, разделенных на ровные кварталы. Территория города делилась на 2 части Коломенской дорогой. Центр города постепенно складывался возле церкви Михаила Архангела. Промышленность в Бронницах практически не развивалась, так как город находился в стороне от железной дороги.

От Бронниц до Московско-Рязанской ж/д была проведена 12-верстная дорога и в 1868 открыта станция. В 1924 г. в городе насчитывалось 3, 5 тыс. жителей, не было ни одного крупного производства. В настоящее время в городе действует ювелирный завод, начало которому было положено еще в 19 в., понемногу возрождается швейное производство, работают частные предприятия по производству стройматериалов. На озере Бельском вырыт гребной канал, являющийся базой для тренировок спортсменов России и стран СНГ.

В церкви Ильи-пророка (при въезде со стороны Москвы, 1870 г.) в настоящее время размещен хозяйственный магазин. Рядом с ней находилось кладбище, где в 1916 г. был похоронен внук А.С. Пушкина — Александр Александрович Пушкин, который многие годы прожил в городе; с 1890-х гг. был земским начальником, председателем Бронницкой уездной думы, много лет избирался предводителем местного дворянства. При его непосредственном участии значительно возросло количество школ, больниц и училищ; построен санаторий для туберкулезных больных в деревне Коняшино, открыта библиотека; начали работать дизельная электростанция, водопровод и мельница. С 1999 близ церкви Ильи-пророка был открыт мемориальный парк в его честь. При храме Ильи-пророка и в центре города А.А. Пушкину поставлены памятники.

На центральной площади — комплекс архитектурных памятников 17-19 вв. Церковь Михаила Архангела (1696-1705 гг.) — высокий 3-светный 5-главый собор, в облике которого объемная композиция посадского храма 17 в. сочетается с декоративными элементами московского барокко. Внутренняя отделка храма интересна наличием на стенах и сводах собора и трапезной лепных барочных картушей. В 1865 г. к храму была пристроена небольшая трапезная. Рядом с алтарем храма сохранились могилы декабристов — И.И. Пущина, М.А. Фонвизина. Над могилой Фонвизиных — бронзовое распятие, над могилой Пущина — статуя ангела.

Церковь Иерусалимская построена в начале 1840-х гг. по проекту архитектора А. Шестакова; принадлежит к числу наиболее поздних образцов архитектуры классицизма. Портик тосканского ордера украшен куполом на небольшом световом барабане. В середине 19 в. на средства местных купцов была выстроена колокольня с часами. Комплекс одноэтажных кирпичных отштукатуренных зданий казарм в стиле ампир (нач. 19 в.), офицерских корпусов и конюшен в плане составляет обширное каре.

Большая часть стен здания покрыта рустом, гладкий пояс над ним прорезан полукруглыми люнетами. Центральный въезд и углы сооружения отмечены павильонами, выделенными наиболее богатой архитектурной декорацией. Надвратный павильон завершен бельведером. Облик здания частично искажен увеличением старых и пробивкой новых окон. В городе в разное время бывали В.Г. Белинский, описавший Бронницы в «Журнале моей поездки в Москву и пребывания в оной», Ф.М. Достоевский, Н.В. Гоголь, Д.В. Григорович, Н.П. Огарев.